El órgano superior de gobierno de ITMATI es su Consejo de Gobierno, presidido por el Presidente de ITMATI, y formado por miembros institucionales, miembros científicos y la Directora de ITMATI.

La Comisión Científico Técnica está formada por investigadores de reconocido prestigio y con amplia experiencia en la transferencia de tecnología matemática. En ella están representados todos los miembros del consorcio ITMATI y las tres áreas científicas principales, Matemática Aplicada, Estadística e Investigación Operativa.

De la Comisión Científico Técnica depende la Comisión Ejecutiva, que se encarga de velar por la gestión del día a día de ITMATI. Para ello está compuesta por personal científico y de gestión y presidida por la Directora de ITMATI.

Nuestra actividad la realizamos en la Unidad de gestión de Transferencia y la Unidad de I+D+i, ambas unidades dependen de la Directora de ITMATI y, junto con el Gerente de ITMATI, trabajan de forma conjunta para investigar, desarrollar, transferir y valorizar productos y servicios en el ámbito de la Matemática Industrial.